Orochimaru y sus ex-compañeros de equipo,
Jiraiya y
Tsunade, se conocen como los Sannin legendarios (伝説の三忍, Densetsu no Sannin
?) o simplemente
Sannin.
Sus padres murieron cuando él era joven, mientras que,
el tercer hokage reconoció rápidamente el talento natural de Orochimaru, diciendo a menudo a
Jiraiya por que no te pareces mas a Orochimaru. El Tercero estaba al tanto de la maldad dentro de Orochimaru, pero eligió fingir no notarlo porque esperaba que podría calmarse esta parte de la personalidad de Orochimaru. Mientras pasaban los años, éste formo una gran amistad con
Jiraiya, aunque no carente de rivalidad.
Después de pasar muchos años de aprendizaje con el tercero, Orochimaru comenzó a estudiar sobre sus deseos internos de obtener inmortalidad con la esperanza de poder aprender todos los
jutsu existentes. Para lograr esta meta, Orochimaru comenzó a secuestrar a aldeanos y a experimentar con ellos, intentando entender mejor cómo trabaja el cuerpo y qué modificaciones podría realizar.
En un experimento, Orochimaru puso a diez niños su propio
sello maldito en un esfuerzo de ver cuál era su tasa del éxito. Uno de los diez seria su propio estudiante,
Anko Mitarashi, ya que ella fue la única en sobrevivir. En otro experimento, él inyectó los genes del
Primer Hokage en sesenta bebés con la esperanza de que consiguieran y dominara la técnica
Mokuton, y la capacidad de controlar a los
Bijū. Orochimaru creyó que todos los bebés de prueba habían muerto pero en realidad, uno de ellos, Tenzou, sobrevivió, y conservó las capacidades que Orochimaru había deseado.
Orochimaru comenzó a ser menos discreto con sus experimentos, permitiendo que el Tercero descubriera lo que hacía. Al ser descubierto, el alumno dio a su maestro anterior la ocasión de matarle, pero el Tercero no podría hacerlo, así que permitió que se escapase. Cuando huyó de la aldea,
Jiraiya, pensando en Orochimaru como un gran amigo, intentó pararlo y persuadirlo para que volviera a
Konoha, aunque Orochimaru lo rechazó y se fue de
Konoha para siempre, adquiriendo gran odio a su antiguo hogar.
Después de dejar
Konoha, Orochimaru entró en conflicto con konoha y se fue a la villa del sonido. También se sabe que intentó tomar el control del cuerpo de
Itachi Uchiha para conseguir su
Sharingan. Debido a sus capacidades,
Itachi pudo prever las intenciones de Orochimaru, y cortarle la mano en que llevaba su anillo de
Akatsuki tras revertir la técnica. Al no poder tomar el cuerpo de Itachi, Orochimaru dejó la organización, se llevó su anillo con él, y
Akatsuki está, quizás consecuentemente, preocupada por capturarlo desde entonces. El encargado de hacerlo era el miembro
Deidara.
Al ser uno de los legendarios
Sannin así como un miembro anterior de la
Organización Akatsuki, Orochimaru es un ninja calificado de "genio". Sin embargo ha exhibido solamente una cantidad limitada de
jutsu. Desde que se fue de
Konoha ha hecho muchas modificaciones a su cuerpo, dando por resultado su forma natural actual, que es la de una serpiente blanca gigante integrada por muchas serpientes más pequeñas. Esta forma tiene las ventajas de permitir que estire cualquier parte de su cuerpo grandes longitudes, regenerar cualquier herida infligida sobre él y utilizar de varias maneras las serpientes que lo componen para el ataque. La culminación de su investigación en inmortalidad se puede también encontrar en esta forma, pues permite que transfiera a un nuevo cuerpo su alma una vez cada tres años y que escape de los efectos de la vejez. Al principio de la serie, Orochimaru dice haber utilizado la capacidad dos veces, aunque una mirada dentro de su subconsciente sugiere que él lo haya utilizado más.
Primera parte [
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Examen de
Chūnin [
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Antes del comienzo de los exámenes de
Chūnin, Orochimaru se alía con la
Aldea Oculta de la Arena, con la intención de invadir
Konoha juntos. Después de matar al cuarto
Kazekage, Orochimaru se disfraza como él para dar la ilusión de la aprobación del líder de la aldea, y la aldea acepta tomar parte en la invasión de Konoha. Antes de que la invasión comience, Orochimaru mata y personifica a una Genin de la hierba y se incorpora a los exámenes con la esperanza de conseguir observar al hermano de
Itachi Uchiha, Sasuke Uchiha. Durante la segunda fase de los exámenes, Orochimaru ataca a
Sasuke para probar sus capacidades.
Durante la batalla, sin embargo, Orochimaru se ve forzado a tratar con
Naruto Uzumaki. Reconociendo a Naruto como una amenaza potencial, Orochimaru sella el chakra del zorro, evitando que
Naruto le tenga acceso y que lo golpee. Después de que la atención de Orochimaru vuelva a Sasuke, éste decide sostener un combate con él, debido al ejemplo de Naruto. Como recompensa a Sasuke por llevar a cabo esa batalla contra él, Orochimaru le pone el
sello maldito del cielo, y desaparece en el bosque circundante, ante esto
Anko lo encuentra y mantiene una corta batalla con el hasta que muestra según su verdadera forma y la deja paralizada por su sello maldito.
A medida que Orochimaru continúa supervisando el progreso de
Sasuke a través de los exámenes, tiene un descuerdo con Kakashi y comienza a preocuparse de la influencia de
Naruto Uzumaki sobre él. Debido a esto, el sannin decide a que debe separar a
Sasuke de Naruto tan pronto como pueda.
Invasión de Konoha [
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Disfrazado como el cuarto
Kazekage, Orochimaru mira los combates finales del examen de
Chūnin con el
Tercer Hokage. Cuando la invasión de
Konoha comienza, Orochimaru se quita su disfraz, revelando que él planeó la invasión con el único propósito de conseguir matar al tercero, así como el secuestro de Sasuke. Cuando los dos comienzan la batalla, Orochimaru resucita los dos primeros
Hokage de modo que el tercero pueda experimentar como es luchar con su anterior maestro.
Los dos Hokage muertos luchan contra el tercero y este en clara inferioridad se ve forzado a usar el
jutsu del cuarto para sellar sus almas. Después de derrotar a los dos Hokages, el tercero vuelve su atención a Orochimaru e intenta sellar también su alma. Detectando lo que está intentando el tercero, Orochimaru atraviesa el tercero por la espalda con la espada de
Kusanagi, y el tercero pierde la fuerza necesaria para sellar completamente el alma de Orochimaru. Haciendo uso del poco poder que le queda, el tercero sella los brazos del sannin en un intento por compensar que dejara escapar a su alumno años atrás. Al hacer eso, le impide utilizar cualquier
jutsu, dejando a Orochimaru en un estado peor que la muerte, después el tercer
Hokage muere y Orochimaru escapa con ayuda de sus secuaces .
Búsqueda de Tsunade [
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Como resultado del sellado de sus brazos, Orochimaru se queja de un gran dolor, y busca a su anterior compañera de equipo,
Tsunade, con la esperanza de que ella pueda restaurar sus brazos. Al encontrarla, la oferta de Orochimaru como pago son resucitar a su antiguo amor y a su hermano pequeño. Aunque ella considera la oferta, después de la reunión con
Naruto Uzumaki, ella declina la oferta, sabiendo que Orochimaru destruiría
Konoha si le cura los brazos. Ella procura matar a Orochimaru, aunque
Kabuto Yakushi lo evita. Sin embargo, Kabuto cae derrotado y Orochimaru se ve forzado a hacer frente no sólo a
Tsunade, si no a
Jiraiya también. En su estado debilitado, Orochimaru no puede presentar mucha oposición en la lucha contra los dos y cae derrotado a pesar de haber convocado a Manda. Huye de la batalla, decidiendo tomar un nuevo anfitrión.
La recuperación de Sasuke [
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En un esfuerzo de intentar usar el jutsu, Orochimaru envía a sus cuatro secuaces, los
cuatro del sonido, para traerle a
Sasuke Uchiha de modo que pueda asumir el control de su cuerpo. Espera de verdad la llegada de Sasuke pues el dolor causado por la
necrosis en sus brazos, inducidos por el sello del tercero, llega a ser inaguantable y hace inutilizable a su cuerpo. Aunque intenta resistir esperando que llegará
Sasuke a tiempo, Orochimaru se fuerza a cambiar al cuerpo de
Gen'yumaru, a pesar de que
Kabuto se había preparado para él. Sasuke llega, aunque Orochimaru debe estar en su nuevo cuerpo por los tres próximos años, así que comienza a entrenar al joven Uchiha para cumplir su promesa de darle a Sasuke el poder que vino a buscar.
Segunda parte [
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Reencuentro con el Equipo Kakashi [
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Sakura, Naruto, Sai y Yamato van en busca del espía de
Sasori, que resulta ser Kabuto, al puente del cielo y la tierra, Yamato disfrazado de Sasori va con el supuesto espía que el marionetista había mandado. Yamato le hace preguntas a
Kabuto, Orochimaru reaparece, Kabuto ataca a Yamato disfrasado y se revela que Orochimaru lo utilizo como experimento con el ADN del Primer Hokage. Justo ahí empieza la batalla,
Yamato llama al resto de su equipo para que le ayude, Orochimaru se enfrenta a
Naruto Uzumaki que está entre ellos, y le provoca diciendo que
Sasuke ha conseguido más poder que él. Enfurecido por las palabras de Orochimaru,
Naruto usa la forma de cuatro colas de
Kyūbi y ataca al Sannin. Aunque Orochimaru parece gozar de la batalla, los ataques de Naruto son extremadamente potentes y le ponen en situaciones cercanas a la muerte. Después de bloquear el ataque más poderoso de Naruto, Orochimaru intenta rechazarle con su
Kusanagi, que apenas puede detener al poderoso jinchuuriki.
Debido a que debe ejercer mucho esfuerzo en el combate, el cuerpo de Orochimaru comienza a flaquear al ser llevado a su límite y debe huír. Mientras que intenta acercarse a
Sai, que le propone una alianza a nombre de su organización, para destruir
Konoha. Orochimaru acepta, y trae a
Sai con él a su escondrijo, donde, al llegar declina su cuerpo. Como él se niega, Sai deja a Orochimaru y se alía con el equipo 7, el sannin lo enfrenta en un esfuerzo de determinar dónde yacen las lealtades del joven ninja realmente. Siendo excedido en número, y todavía cansado de su lucha con
Naruto Uzumaki, Orochimaru se ve forzado a dejar ir a Sai. Orochimaru reaparece más adelante para apartar a Sasuke del equipo 7,
Sasuke, queriendo hacer lo que sea necesario para hacer la matanza
Itachi Uchiha más fácil, acepta, y desaparece con su maestro.
El desafío de Sasuke y la derrota del Sannin [
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Orochimaru aparece con Sasuke después de que el último haya derrotado un gran grupo de ninjas. Admirando la capacidad de
Sasuke para derrotar al grupo sin ser dañado, Orochimaru piensa que el talento de Sasuke ha sobrepasado incluso el suyo a la edad de
Sasuke y esta encantado por el hecho de que el cuerpo de Sasuke pronto será el suyo. Mientras que Orochimaru yace en su cama, el cuerpo que él habita comienza a fallar, Sasuke lo ataca indicando que él no tiene nada bueno que aprender de Orochimaru,
Sasuke activa su sello maldito y su
Sharingan. Al prever esto, Orochimaru revela su forma verdadera como preparación de tomar el cuerpo de Sasuke. Después de avanzar al nivel 2 de su sello maldito
Sasuke puede desmembrar al sannin, matando aparentemente a éste.
Mientras que retrocede su sello maldito,
Sasuke se encuentra paralizado por el veneno de Orochimaru, este se regenera de modo que puede tomar el cuerpo de Sasuke. Éste es transferido a una dimensión dentro de Orochimaru y comienza a tomar el control del cuerpo del joven Uchiha, aunque éste procura utilizar su
Sharingan para detener el proceso. Cuando
Kabuto entra en el cuarto, encuentra a
Sasuke tranquilo y la forma verdadera de Orochimaru desmembrada por completo. Cuando Sasuke sale del cuarto,
Kabuto pregunta si él es Orochimaru o Sasuke. Éste utiliza su
Sharingan para mostrarle la confrontación final entre los dos en la dimensión de Orochimaru, de la cual
Sasuke sale como vencedor, aunque Orochimaru sigue vivo en su interior, dormitando, de la misma forma en que otros han estado dentro de él antes.
Kabuto Yakushi revela que insertó en su cuerpo los restos de Orochimaru, con la esperanza de volverse más fuerte. Estos al parecer se están apoderando de él gradualmente, ya que su ojo izquierdo se ha puesto igual al de Orochimaru.
Hinata con su
Byakugan vio dentro de él una pelea entre los dos chakras.
Sasuke contra Itachi [
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Avanzada la batalla entre
Sasuke e
Itachi Uchiha, el mayor de los hermanos se ve forzado a usar la técnica definitiva de su
Mangekyō Sharingan, el
Susanō, después de haber fallado con Tsukuyomi y Amaterasu y haber sido herido por el Kirin de Sasuke. El joven uchiha está sin técnicas o chakra y el sannin aprovecha la coyuntura para ofrecerle su ayuda y derrotar su hermano. Sasuke claudica y libera el chakra que retenía a Orochimaru, este emerge con su Yamata no jutsu sobre Itachi, pero el Susanō se deshace de las cabezas de la gran hidra. El sannin emerge de una de ellas con su espada Kusanagi y se dispone a tomar el cuerpo de
Sasuke, no obstante la espada de Totsuka de Susanō traspasa al sannin y lo sella en un mundo de genjutsu eterno, haciendo que se retire definitivamente de Sasuke, que permanece de rodillas y a merced de Itachi.
Todo el chakra de Orochimaru es sellado por el Susanō, y una pequeña serpiente blanca logra escapar y esconderse entre los escombros y permanecer oculta mientras
Itachi logra tener a su merced a Sasuke, el mayor de los Uchiha pierde sus fuerzas finalmente y se desploma al tiempo que su Susanō desaparece,
Sasuke mira al cielo y la pequeña serpiente blanca sale de su escondrijo. El Amaterasu se extiende al bosque cercano y las llamas oscuras alcanzan a la pequeña serpiente blanca en su huida, calcinándola en cuestión de segundos.